สำนักวิจัยเป็นหน่วยงานกลางของสถาบันมีบทบาทและพันธกิจในการส่งเสริมและสนับสนุนงานวิจัยของสถาบัน การบริการวิชาการ การบริการด้านแหล่งทุนวิจัย และด้านการเผยแพร่ผลงานวิจัยของสถาบันในรูปแบบต่างๆ โดยมุ่งเน้นทำงานวิจัยในประเด็นต่างๆ เพื่อแก้ไขปัญหาและพัฒนาประเทศ เพื่อยกระดับคุณภาพการเป็นสถาบันด้านงานวิจัยและการให้บริการ และเพื่อตอบสนองต่อยุทธศาสตร์การพัฒนาระยะยาว สถาบันบัณฑิตพัฒนบริหารศาสตร์ (พ.ศ.2551-2565) ในยุทธศาสตร์ที่ 6 การรักษาความเป็นเลิศทางวิชาการด้านหลักสูตรงานวิจัยและการบริการวิชาการที่มีความโดดเด่นและสอดคล้องกับความต้องการของสังคม

ศูนย์วิจัยการปฏิรูปและการประเมินผลกิจการภาครัฐ เป็นหนึ่งศูนย์วิจัย 12 ศูนย์ภายใต้กองงานวิจัย จัดตั้งขึ้นเมื่อปี พ.ศ. 2555 โดยมีเป้าหมายเพื่อวิจัยปัญหาต่างๆของระบบราชการและการประเมินผลโครงการภาครัฐของประเทศ ซึ่งจะนำไปสู่การพัฒนาข้อเสนอแนะเชิงนโยบายที่เกี่ยวข้องกับการปฏิรูประบบราชการและการประเมินผลโครงการภาครัฐ เพื่อทำให้ระบบราชการไทยมีประสิทธิภาพมากขึ้นและปรับตัวให้สอดคล้องกับการเปลี่ยนแปลงของโลกต่อไป และสามารถตอบสนองความต้องการของสังคมๆได้อย่างมีคุณภาพมากขึ้น